核酸凝胶电泳引言:核酸是带均匀负电荷的生物大分子,在电场中向正极移动,不同大小和构象的核酸分子的电荷密度大致相同,在自由泳动时,各核酸分子的迁移率区别很小,难以分开。以适当浓度的凝胶介质作为电泳支持介质,具有分子筛效应,使得分子大小和构象不同的核酸分子泳动率出现较大差异,达到分离的目的。此为分离、鉴定、纯化核酸片段的标准方法。用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙锭(EB)进行染色,可直接在紫外灯下确定DNA在凝胶中的位置。影响核酸电泳的因素:•1.核酸的性质•2.凝胶孔径的大小•3.电场强度和电场方向•4.电泳环境缓冲液的组成和离子强度直接影响迁移率。核酸电泳的指示剂:•核酸电泳常用的指示剂有两种:•⑴溴酚蓝•⑵二甲苯青,DNA的琼脂糖凝胶电泳•引言:琼脂糖主要从海洋植物琼脂中提取来的,为一种聚合线性分子,一般含有多糖、蛋白质和盐等杂质,杂质的含量每个厂商和批号的产品不尽相同。对DNA电泳迁移率的影响也不一样,经化学修饰后熔点降低的琼脂糖叫低熔点琼脂糖,其机械强度无明显变化,主要用于DNA的限制酶原位消化、DNA片段回收以及小DNA片段(10~500bP)的分离。琼脂糖凝胶的孔径取决于琼脂糖的浓度。•【实验目的】•掌握DNA琼脂糖凝胶电泳的原理和操作方法。【实验原理】•DNA分子带负电荷,在电场中受到电荷效应、分子筛效应向正极移动过程中,因DNA分子的大小及构象差别而呈现迁移位置上的差异,对于线形DNA分子,其电场中的迁移率与其相对分子质量的对数值成反比,电泳时加溴化乙锭,其与DNA结合形成一种荧光络合物,在254~365nm紫外光照射下可产生桔红色的荧光,可用于检测DNA(此法可观察到凝胶中2ng的DNA)。如有必要可从凝胶回收DNA片段,用于分子克隆或探针标记等操作。琼脂糖可制成不同孔径的凝胶,分离DNA的范围广,约200bp~50kb。【实验材料】•1.电泳仪。•2.电泳槽。•3.紫外透射仪。•4.试剂【实验方法】•1.琼脂糖凝胶板的制备将1~2%琼脂糖凝胶加热溶化均匀,冷却到60~70℃加EB至浓度0.5μg/ml,倒入封好的凝胶槽,厚度约3~5mm,在距底板0.5~1mm的位置放置样品梳,检查梳子齿间有无气泡,可用吸管小心吸出气泡,待冷却成形后取出梳子及隔板,放入水平电泳槽中,缓冲液淹没过胶1~2mm为止。•2.加样样品中加1/5体积的上样缓冲液,混匀,取10~15μl加入凝胶点样孔中,同时要设立合适的DNA相对分子质量标准物。•3.电泳电压<10V/cm,电泳至溴酚蓝移出样品槽到凝胶板的2/3距离时,关闭电源。•4.取出凝胶块,置紫外透射反射分析仪上观察,即可见桔红色DNA区带。【实验思考】•1.影响DNA片段琼脂糖电泳有哪几个因素?操作DNA琼脂糖凝胶电泳时为何要戴手套?•2.DNA片段琼脂糖电泳操作应注意哪些问题?