开机步骤1.分别打开质谱、液相色谱和计算机电源，此时质谱主机内置的CPU会通过网线与计算机主机建立通讯联系，这个时间大约需要1至2分钟。2.等液相色谱通过自检后，进入Idle状态，依照液相色谱操作程序，依次进行操作。（具体根据液相色谱不同型号来执行，下面以2695为例）。a.打开脱气机(DegasserOn)。b.湿灌注(WetPrime)。c.PurgeInjector。d.平衡色谱柱。3.双击桌面上的MassLynx4.0图标进入质谱软件。注：如果进入Masslynx软件时出现提示：“Theembeddedsystemisnotresponding,Thesystemwillruninstandalonemode”，则说明质谱内置的CPU(EPC)与电脑主机的通讯联系还未建立，此时无法控制质谱，请稍等后再进入软件，如果打开软件仅为处理数据则没有关系（质谱主机电源未开时进入软件也会有同样提示）。4.检查机械泵的油的状态（每星期），如果发现浑浊、缺油等状况，或者已经累积运行超过3000小时，请及时更换机械泵油。5.点击质谱调谐图标（MSTune）进入质谱调谐窗口。6.选择菜单“Options–Pump”，这时机械泵将开始工作，同时分子涡轮泵会开始抽真空。几分钟后，ZQ就会达到真空要求，ZQ前面板右上角的状态灯“Vacuum”将变绿。7.点击真空状态图标，检查真空规的状态，以确认真空达到要求。8.确认氮气气源输出已经打开，气体输出压力为90psi。9.设置源温度（SourceTemp）到目标温度。质谱调谐窗口各项参数设定电喷雾电离源（ESI）1.在质谱调谐窗口选定要使用的离子模式。2.点击进入下面Source界面，设定Source界面里的各项参数。Capillary(KV)Cone(V)Extractor(V)RFLen(V)SourceTemp加在ESI源内毛细管上的高压，正离子模式一般是在2.5-3.75KV之间优化，负离子模式一般是在2.0-3.0KV之间优化。在负离子模式时，如果毛细管电压设置过高容易引起放电现象。样品锥孔电压，一般在10-100V之间优化，通常来说，分子量小的样品选择的锥孔电压要相对小，当提高锥孔电压时，可能得到的碎片信息会多一些。二级锥孔电压，一般在0－5V之间优化。六级杆透镜电压，一般在0－0.5V之间优化。源温度，一般在80℃－120℃之间优化，一般来讲，温度的设定与进入质谱流动相流速大小有关。如果用注射泵直接进样，流速在5－4uL/min时，设为80℃，当液相色谱流速在100－300uL/min时，设定为120－150℃。DesolvationTemp脱溶剂气温度，一般在120℃－300℃之间优化，与流动相流速大小、流动相含水比例高低、是否容易气化相关。用注射泵直接进样，流速在5－40uL/min时，设为120℃，当液相色谱流速在100－300uL/min时，设为300℃。Desolvation(L/hr)脱溶剂气流量，一般在300－1000L/Hour之间优化，与流动相流速大小、流动相含水比例高低、是否容易气化相关。Cone(L/hr)锥孔气的流量，一般在0－100L/Hour之间优化。3.点击图标，进入Analyser界面，设定Analyser界面里的各项参数。LMResolution低质量数分辨率，典型值15.0。HMResolution高质量数分辨率，典型值15.0。高。一般来讲，分辨率越高，灵敏度越低，分辨率越差，灵敏度越注意：当改变分辨率的时候，质量数也会有轻微的偏移，所以在不同分辨率的条件下，应该做质量数校正。IonEnergy离子能量，一般在0－1之间优化。Multiplier光电倍增管电压，典型值650V。大气压化学电离源（APCI）Corona高压放电针电流，正离子模式一般在0－10uA之间优化，负离子模式一般在0－5uA之间优化。SourceTemp源温度，一般在120℃－150℃之间优化。APCIProbeTempAPCI加热器温度，一般在300℃－600℃之间优化。其余参数设定与ESI相同。创建项目和打开项目（Project）为了便于进行数据管理，可以创建不同的项目（Project），项目的后缀为.pro，每个项目都有对应的子目录进行相应文件的管理。1.从主菜单中选择“File–ProjectWizard”，会引导你去创建一个新的项目。2.输入项目名称（Projectname）、描述(Description)、存放的路径(Location)，点击“Next”，进入下一步。3.选择a)Createnewproject，完全新建一个项目。b)CurrentprojectasTemplate，将会把上一次所使用项目的子目录（Acqudb、Methdb、Sampledb）里的方法拷贝到你新建的项目中去。c)Createusingexistingprojectaste...
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