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聚合酶链反应在幽门螺杆菌感染中的新进展VIP专享VIP免费

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聚合酶链反应在幽门螺杆菌感染中的新进展来源:中国论文下载中心[07-08-3116:48:00]作者:未知编辑:studa20关键词:聚合酶链反应幽门螺杆菌感染发现幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,Hp)至今已有十多年,在这十多年期间对Hp的研究进展飞速,已从细胞水平逐渐深入到分子水平。现在认为Hp是胃炎,消化性溃疡的主要致病因素,而且与胃癌有密切关系。Hp本身的螺形,鞭毛结构及其分泌的细菌毒素,空泡毒素,尿素酶,粘蛋白酶,过氧化氢酶,磷脂酶,热休克蛋白,低分子趋化性蛋白质粘附素等都与其致病相关。诊断Hp感染已从传统的细菌学,免疫学手段发展到分子生物学方法,尤其是通过分析Hp核酸,已清楚Hp的部分核苷酸序列,这为聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)用于Hp研究创造了条件。本文就近年有关PCR在Hp研究中的应用作一综述。1PCR原理PCR是近年发展起来的一种体外扩增特DNA片段的技术,有关它的原理许多文献已有详细介绍,这里只作简述PCR的每次扩增循环包括三步,第1步为变性,在高温下把双链靶DNA拆开;第2步,在较低的温度下使引物与靶DNA互补;第3步在中间温度下,在DNA多聚酶作用下,引物按模板DNA延长,典型的PCR包括30~50循环,如此重复循环,使被扩增的靶核苷酸以几何级数扩增,在PCR操作中,有几点必须考虑。①选择引物长度以15~30个碱基为宜,太短特异性不佳,太长不增加特异性而合成费用增加。②引物中应尽量避免单高重复的核苷酸结构,同时还要考虑引物本身的物理特性,避免经物自身退火。③反应的退火温度慎重选择,温度高可提高特异性,但敏感性隆低,温度低则反之。2引物选择2.1尿素酶基因核苷酸Hp分泌大量的尿素酶,该酶是导致哺乳动物对Hp产生免疫应答的重要抗原,可能是Hp的重要致病因子之一,因此许多学者采用尿素酶核苷酸序列中的部分片段作为引物。Clayton等报告了Hp尿素酶基因(ureA和tureB)的核苷酸序列,筛选到ureA和tureB两个亚单位,并测得了它们的核苷酸序列。目前有代表性的采用以尿素酶部分核苷酸顺序为引物对的有:Clayton采用一对18个碱基的寡核苷酸链为引物,特异引导扩增后的DNA产物为411个碱基对。其他学者都是以Clayton报告的Hp尿素酶基因的部分核苷酸序列为依据而设计PCR的引物。Courcoux等选择尿一纱酶C基因中的一段294bp作PCR反应。2.216SrRNA核苷酸顺序所有细菌的rRNAs根据其大小分为三种:含120个核苷酸的5srRNA;含1600个核苷酸的16SrRNA及含3000个核苷酸的23SrRNA。分析细菌16srRNA现已作为细菌分类的一个指标。大量研究证明,Hp的部分16srRNA与弯曲菌属细菌显著不同,目前采用以16SrRNA部分核苷酸顺序为引物的主要有Ho等,采用一对20个碱基的寡核苷酸链为引物,特异引导扩增后的DNA产物为109个碱基对。有些学者用PCR拉增Hp及与其相类似微生物的16srRNA,以此来识别H.pylori,H.mustelac和H.canis。2.3编码Hp特6kD蛋白质的核苷酸O'Toole等报告Hp提取物中大量的26000蛋白质,作者提出此蛋白质是Hp特异蛋白质,并分析编码该蛋白质核苷酸序列。Hammar等以此为依据,设计一对23个碱基的寡核苷酸链为引物,特异引导拉增后的DNA产物为298个碱基对。2.4其它Valentine等从基因库中选出1.9kd的DNA片段作为探针,与19株Hp反应都为阳性,与32种306株其它细菌均无反应,其特异性为98.7%,假阳性是由于载体污染。由此作者从1.9kdDNA中的已知288个碱基片段中选出一对20个寡核苷酸链为引物,其特异引导扩增后DNA产物为203个碱基对。纵观不同学者选出的引物,这些引物都能特异地以Hp的DNA为模板,扩增Hp的部分核苷酸,而不引导扩增其它细菌的核苷酸。3应用3.1临床诊断自从成功分离出Hp以来,由于Hp感染在临床上的重要性,迫切需要一个快速敏感检测检测标本的方法,学者们在不断探索各种诊断Hp感染的方法。传统的培养方法由于细菌生长要求高,死亡或菌量过少,则常规方法难以检出,其它方法如同位素标记的二氧化碳呼气试验,费用贵,快速尿素酶试验由于制剂标准不统一,消化道其它一些细菌也产生尿素酶,使该方法的特异性受到影响,检测抗Hp抗体方法简易,但很难区分是否为近期感染,随着分子生物学技术不断发展,最近有些实验室采用PC...

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