基因芯片技术在耐药检测中的研究概况马小林,李英伦(四川农业大学动物科技学院药理实验室雅安625014)摘要:基因芯片技术是近几年在国际上迅猛发展起来的一项高新技术,是生物技术与芯片技术相结合的产物。它在耐药检测研究中的应用将对耐药机制的研究、新的耐药基因的发现以及耐药个体化诊断具有极大的促进作用。关键词:基因芯片;耐药性;生物技术;病原微生物;耐药肿瘤ThefunctionofgenechiptechnologyinthemedicineexaminationMaxiao-lin,Liying-lun(CollegeofAnimalScienceandVeterinaryMedicine,Pharmacologylaboratory,SichuanAgriculturalUniversity,Yaan625014,China)Abstract:Thegenechiptechnologyisaninternationalswiftandviolentdevelopmenthigh-techinrecentyears,itistheassociatedproductionofbiologicaltechnologyandthechiptechnology,ithastheenormouspromotinthestudyandresearchaboutdrugsresistanceandtheapplicationinthedrugsresistancemechanismresearch,thediscoverydrugsresistancenewlygene,aswellasthedrugsresistanceindividualdiagnosis.Keywords:Genechip;Drugsresistance;Technologyofbiology;Pathogenicmicroorganism;Bearsthemedicinetumor基因芯片技术是利用生物遗传法则,根据体内核酸中碱基配对、转录原理发展起来的一项新技术。至今,芯片技术已在医学领域中显示了其巨大的发展潜力并取得了一定的成功,为病原微生物的分子诊断技术提供了良好的发展前景。随着多种微生物全序列测定的完成,基因芯片技术的日臻完善,使基因芯片不仅能监测体外生长的细菌,而且可进行细菌的诊断、鉴别诊断、耐药性检测,亦可用于潜伏期或感染过程中的研究。本文就基因芯片在耐药检测中的应用和研究现状及其应用前景作一概述。1.基因芯片和基因芯片技术概述1.1概念基因芯片(genechip),又称DNA微阵列(DNAmicroarray),是近几年发展起来的一项前沿生物技术[1]。它是指通过光蚀刻、化学合成及微细加工工艺技术等方法,在很小的介质(如硅片、玻璃、尼龙膜等)表面合成,固定核酸、蛋白质及多肽序列形成高密度的点阵,与样品来源制备的探针杂交后,通过特殊的装置检测信号,并由计算机进行分析、综合,从而获得大量的生物信息,进行功能基因组的研究,更多地揭示基因之间表达变化的相互关系。其优势体现在快速、高效、高通量处理生物学信息的能力。基因芯片技术的开发始于90年代初期,其技术的发展得益于二项关键技术的发明,其一为非孔的固相支持介质,如玻璃片的使用,使微量和荧光检测技术的实现成为可能;其二是高密度原位合成寡核苷酸的方法,如Stevefoder研究小组采用半导体制作技术中的光路印刷屏蔽技术,生产高密度的寡核苷酸芯片,在仅20wm的玻片表面合成,固定达400000个寡核苷酸探针[2]。1.2分类基因芯片有多种分类方法,根据基因芯片的用途不同,可以分为表达芯片(expressionchip)、基因组芯片(genomicchip)和测序芯片(sequencingchip);根据芯片上核苷酸的长度不同,可分为寡核苷酸芯片(oligo-chip)、cDNA芯片和基因组芯片。尽管分类方法有很多,但其制作过程不外乎二种,一是原位合成寡核苷酸制备芯片,二是将制备好的DNA片段排列到固相载体上。作者简介:马小林(1980-),男,四川泸州人,在读硕士,主要从事新兽药研究与开发。1.3应用1.3.1基因表达研究:主要方法是从不同来源的个体、组织,不同的细胞周期、细胞发育阶段及分化程度,不同的病变,各种刺激(包括不同诱导,不同治疗阶段)的细胞内的mRNA或逆转录为cDNA后,与表达谱基因芯片进行杂交,通过这些在不同条件的检测对象与正常对照之间的综合比较、分析和判断,同时进行成千上万个基因的研究,迅速而准确地将某些基因与疾病建立联系,同时明确这些基因功能及确立这些基因间内在的相互作用关系。1.3.2基因分型研究:通过与基因芯片杂交结果的分析,可以了解同一种疾病的不同基因变化情况。由于患者基因型的个体差异性,使治疗方案复杂化,而有了基因芯片确立患者的基因分型,可以帮助临床治疗方案个体化,这在白血病等疾患中表现得尤为突出及有价值。比如,许多形态学相似的白血病亚...