电脑桌面
添加小米粒文库到电脑桌面
安装后可以在桌面快捷访问

向GenBank批量上传序列的方法VIP专享VIP免费

向GenBank批量上传序列的方法_第1页
向GenBank批量上传序列的方法_第2页
向GenBank批量上传序列的方法_第3页
向GenBank批量上传序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文档:待上传序列删减至合适长度后,将待上传序列全部打开随后点击File-exportasone,保存文件格式为:*.fas,将待上传序列全部归至一个FASTA文档。注意序列命名:2.在GenBank的SubmissionTools里,下载序列信息编辑软件Sequin。网址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/(下图中点击Instructions下载软件)注意打开安装文件后,程序会自动安装在安装包所在的文件夹。3.打开Sequin,点击StartNewSubmission。4.随后选择序列发布日期,输入论文题目。若之前保存有模板,可以点击下面的“Clickheretoimportatemplate”导入。模板导出在下文的第五点提到。5.联系人、作者信息、机构或者学校信息建议导出模板,之后修改信息时可以直接导入模板而不需重新输入。6.选择上传的序列类型。7.导入之前准备好的FASTA文件:导入之后,输入序列ID(序号ID相当于编号,可以自由命名,只要各个序列的ID不一致即可。在这里以病人编号作为序列ID):导入序列成功后,显示各个序列信息如下:点击SequencingMethod,将测序方法输入:选择上传序列的用途:病毒类型:8.编辑每条序列的信息:点击ImportSourceTable可以导入模板,点击ExportThisTable可以输出模板备用。9.选择核酸类型,序列内容后,点击OpenRecordViewer。10.添加每条序列的信息,包括编码区重复区RNA结构等等。双击相关信息可进行修改,点击Annotate添加相关信息。11.检查信息是否有误(也可以点击Search里的Validate检测是否有明显错误):有些错误是可以忽略的,如上传的序列为CDS序列,那么软件报错”序列无终止子”时可忽略。随后,点击Done保存待上传序列:注意此时保存的文件包含所有序列信息,因此只需保存一次即可。12.将保存好的文件作为邮件附件,发送至:gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov13.收到accessionnumber即表示上传成功。

1、当您付费下载文档后,您只拥有了使用权限,并不意味着购买了版权,文档只能用于自身使用,不得用于其他商业用途(如 [转卖]进行直接盈利或[编辑后售卖]进行间接盈利)。
2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。
3、如文档内容存在违规,或者侵犯商业秘密、侵犯著作权等,请点击“违规举报”。

碎片内容

确认删除?
VIP
微信客服
  • 扫码咨询
会员Q群
  • 会员专属群点击这里加入QQ群
客服邮箱
回到顶部