整理by raimi DICP-1816 菌株管理档案1——细菌菌株基因型及基因符号说明 1大肠杆菌基因型及遗传符号说明 前言:实验室的一般大肠杆菌拥有4288 条基因,每条基因的长度约为950bp,基因间的平均间隔为118bp(基因Ⅷ)。E.coli 基因组中还包含有许多插入序列,如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段,这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的,由此表明了基因组具有它的可塑造性。 利用大肠杆菌基因组的这种特性对其进行改造,使其中的某些基因发生突变或缺失,从而给大肠杆菌带来可以观察到的变化,这种能观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型 (Phenotype),把引起这种变化的基因构成叫做大肠杆菌的基因型(Genotype)。具有不同基因型的菌株表现出不同的特性。 分子克隆中常用的大肠杆菌及其遗传标记按Demerec 等1966 年提出的命名原则,采用的菌株所有的基因都假定处于野生型状态,除非在基因型上另外注明。 大肠杆菌基因型的表示方法(Demerec, et, al. 1966): 一、一般规则: 1、根据基因产 物 或其作 用产 物 的英 文 名称 的第 一个 字 母 缩 写 成 3 个 小 写 斜 体字 母 来表示 。例 如: DNA Adenine Methylase→ dam。 2、不同的基因座 ,其中任 何 一个 突变所产 生的表型变化可能相 同,其表示 方 法 是在3 个 小写 斜 体字 母 后 加 上一个 斜 体大写 字 母 来表示 区 别 。例 如: Recombination→ recA、recB、recC。 3、突变位 点 应 通 过 在突变基因符号后 加 不同数 字 表示 。如su pE44(su p 基因座 E 的44 位突变)。如果 不知 道 几 个 等位 基因中哪 一/几 个 发生了功 能性突变,则用连 字 符“ -” 代 替 大写 字 母 ,如trp-31。 4、细菌的基因型中应 该 包含关 于其携 带的质 粒 或附 加 体的的信 息 。这些符号包括 菌株携 带的质 粒 或附 加 体、质 粒 或附 加 体上的突变基因座 和突变位 点 。其基因符号应 与 基因座 的表示符号明显 区 别 ,符号的第 一个 字 母 大写 、不斜 体并 位 于括 号内 ; 质 粒 或附 加 体上的突变基因座 和突变位 点 的基因符号的表示 方 法 与 染 色 体上突变基因座 、突变位 点 的符号相 同。 5、对于携 带附 加 体的菌株的完 整基因型描 述 应 包括 附 加 体的状态(游 离...